Valérie Golaz

Les indicateurs liés aux tests illustrent bien ce que l’on sait de la diffusion de l’épidémie dans la population sur le territoire français. En revanche, ils ne sont pas représentatifs de l’ensemble de la population. Pour que les indicateurs représentent l’ampleur réelle de l’épidémie dans la population, il faudrait en effet que toutes les catégories de la population soient testées proportionnellement à leur part dans la population. Or, les dépistages privilégient les personnes qui ont une santé à risque ou qui présentent des symptômes. De plus, le nombre de tests effectués et les personnes testées varient selon la période. Par exemple, l’un des graphiques du point hebdomadaire de Santé publique France montre comment le nombre de tests effectués est sensible à la conjoncture : baisse brutale dans les deux semaines qui ont suivi le discours du premier ministre de fin septembre indiquant que les contacts des cas contacts ne devaient pas être considérés comme des cas contacts (semaines 39 et 40 : 21 septembre - 2 octobre 2020), augmentation forte au moment des congés de fin d’année. Plus de tests entraine forcément le dépistage de plus de cas positifs, et un taux de positivité des tests plus faible. Les utilisateurs de ces données de suivi oublient souvent les relations qui existent entre ces données et le fait qu’elles ne proviennent à aucun moment d’un échantillon représentatif de la population.

Les données sur les tests remontent par voie électronique dans le « système d’informations de dépistage » (SI-Dep), une plate-forme sécurisée mise en place par Santé publique France dans le cadre de l’état d’urgence sanitaire. Il s’agit d’un recueil exhaustif de certains types de tests: à l’heure actuelle tous les tests RT-PCR et antigéniques effectués sont concernés. Ce recueil comprend des informations sur la personne testée, en particulier le lieu de résidence, le sexe et l’âge, ce qui permet la réalisation de cartes et de graphiques précis. Cependant, comme pour toute collecte de données, les données recueillies ne peuvent être parfaites. Certaines informations manquent parfois, d’autres sont saisies rapidement dans les laboratoires ou les pharmacies. Selon l’information manquante, les données sont écartées ou remplacées. Ainsi, par exemple, si le lieu de résidence du patient est absent, il est parfois remplacé par le code postal du lieu du test, et parfois le cas n’est pas pris en compte dans les résultats. De plus les données remontent dans le système SI-Dep lorsqu’elles sont saisies, c’est-à-dire pas forcément le jour du test. Les remontées journalières, qui sont fortement publicisées, dépendent du jour de la semaine et comportent un délai variable avec le jour où le test a été effectué. Ces statistiques journalières connaissent donc une forte variabilité et doivent être interprétées avec prudence, tout comme les statistiques par commune désormais disponibles sur le site de Santé Publique France.  Il est important de comprendre toutes les limites de ces données pour une bonne interprétation des résultats. 

Voir aussi : 

Golaz V., Gastineau B., Flahaux M.-L., dos Santos S., 2020. Quatre questions-clés sur sur les indicateurs de suivi de l’épidémie de Covid-19 en France.